Maria war das achte Kind von Francesco I. d'Este (1610-1658) und seiner ersten Gattin Maria Farnese (1615-1646). Sie war eine Urenkelin von Virginia de' Medici, der Herzogin von Modena und Reggio. Geboren wurde sie am 8. Dezember 1644 und starb am 20. August 1684. Am 1. Januar 1668 war sie mit ihrem Cousin und ehemaligem Schwager Ranuccio II. Farnese (1630-1694), dem Herzog von Parma und Piacenza, verheiratet worden. Sie war seine dritte Gattin und schenkte ihm neun Kinder, u. a. seine beiden Nachfolger, seinen Sohn Francesco (1678-1727) und seinen Sohn Antonio (1679-1731).
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